Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRK1Q15835 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRK1Q15835 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRK1Q15835 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRK1Q15835 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRK1Q15835 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRK1Q15835 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRK1Q15835 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRK1Q15835 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRK1Q15835 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRK1Q15835 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRK1Q15835 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRK1Q15835 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRK1Q15835 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRK1Q15835 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRK1Q15835 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRK1Q15835 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRK1Q15835 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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GRK1Q15835 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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GRK1Q15835 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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GRK1Q15835 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRK1Q15835 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRK1Q15835 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRK1Q15835 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRK1Q15835 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRK1Q15835 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRK1Q15835 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRK1Q15835 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRK1Q15835 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRK1Q15835 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRK1Q15835 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRK1Q15835 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRK1Q15835 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRK1Q15835 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRK1Q15835 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRK1Q15835 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRK1Q15835 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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GRK1Q15835 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GRK1Q15835 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRK1Q15835 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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