Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SF3B3Q15393 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SF3B3Q15393 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SF3B3Q15393 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms