Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC41■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
EEA1Q15075 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
EEA1Q15075 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.86■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
EEA1Q15075 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
EEA1Q15075 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.73■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
EEA1Q15075 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms