Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF6Q15052 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF6Q15052 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF6Q15052 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF6Q15052 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF6Q15052 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms