Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCAPHQ15003 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NCAPHQ15003 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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