Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBM39Q14498 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBM39Q14498 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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