Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAPGEF1Q13905 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAPGEF1Q13905 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAPGEF1Q13905 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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