Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKP1Q13835 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PKP1Q13835 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PKP1Q13835 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
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