Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA9Q13797 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA9Q13797 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA9Q13797 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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