Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR1Q13613 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR1Q13613 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR1Q13613 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR1Q13613 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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