Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB3Q13509 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBB3Q13509 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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