Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SQSTM1Q13501 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SQSTM1Q13501 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQSTM1Q13501 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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