Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.65■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
MAP3K1Q13233 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K1Q13233 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.53■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
MAP3K1Q13233 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
MAP3K1Q13233 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
MAP3K1Q13233 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms