Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3BQ13214 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3BQ13214 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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