Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA1Q13131 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAA1Q13131 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA1Q13131 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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