Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1BQ13112 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHAF1BQ13112 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1BQ13112 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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