Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms