Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMAN2Q12907 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN2Q12907 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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