Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BPTFQ12830 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPTFQ12830 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPTFQ12830 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPTFQ12830 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
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