Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PMPCAQ10713 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCAQ10713 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms