Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOBRQ0VD83 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBRQ0VD83 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
APOBRQ0VD83 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
APOBRQ0VD83 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.2 ms