Protein–RNA interactions for Protein: Q08964

YPL216W, Putative ISWI chromatin-remodeling complex subunit YPL216W, yeastyeast

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL216WQ08964 MSC3YLR219W 2187 nt7.46□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 HHY1YEL059W 309 nt7.45□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 PAC10YGR078C 600 nt7.45□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 PRI1YIR008C 1230 nt7.45□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 ICP55YER078C 1536 nt7.45□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 AFG2YLR397C 2343 nt7.45□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 ATO2YNR002C 849 nt7.44□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 REG2YBR050C 1017 nt7.44□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 PAC2YER007W 1557 nt7.44□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 SEC23YPR181C 2307 nt7.44□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 EFM1YHL039W 1758 nt7.43□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 MRPL28YDR462W 444 nt7.43□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 CBR1YIL043C 855 nt7.43□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 AAD14YNL331C 1131 nt7.43□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 YEL023CYEL023C 2049 nt7.43□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 GSH1YJL101C 2037 nt7.43□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 FRT1YOR324C 1809 nt7.43□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 COX15YER141W 1461 nt7.43□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.42□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 AGX1YFL030W 1158 nt7.42□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 ARA2YMR041C 1008 nt7.42□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 AIM2YAL049C 741 nt7.41□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 SEC62YPL094C 825 nt7.41□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 TUF1YOR187W 1314 nt7.41□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 MCH2YKL221W 1422 nt7.41□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 ERS1YCR075C 783 nt7.4□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 GGC1YDL198C 903 nt7.4□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 YGL102CYGL102C 429 nt7.4□□□□□ -1.22
YPL216WQ08964 NDE1YMR145C 1683 nt7.4□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 PLB3YOL011W 2061 nt7.4□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 RGD2YFL047W 2145 nt7.4□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 SSC1YJR045C 1965 nt7.39□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 CRH1YGR189C 1524 nt7.39□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 MTR3YGR158C 753 nt7.39□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 YSC83YHR017W 1158 nt7.39□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 PTC7YHR076W 1032 nt7.39□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 YKL077WYKL077W 1179 nt7.39□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 ASR1YPR093C 867 nt7.39□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 SMX3YPR182W 261 nt7.39□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 YBR113WYBR113W 483 nt7.39□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 TAH11YJR046W 1815 nt7.38□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 FAF1YIL019W 1041 nt7.38□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 YPR076WYPR076W 375 nt7.38□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 HBN1YCL026C-B 582 nt7.38□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 DOT1YDR440W 1749 nt7.38□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 STF1YDL130W-A 261 nt7.37□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 PPH21YDL134C 1110 nt7.36□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 ARC35YNR035C 1029 nt7.36□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 FMP40YPL222W 2067 nt7.36□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 YNR014WYNR014W 639 nt7.35□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 CYB2YML054C 1776 nt7.35□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 KIN1YDR122W 3195 nt7.34□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 SRF1YDL133W 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 KDX1YKL161C 1302 nt7.34□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 NTG1YAL015C 1200 nt7.34□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 YLL056CYLL056C 897 nt7.34□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 PUS5YLR165C 765 nt7.34□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 PPS1YBR276C 2424 nt7.34□□□□□ -1.23
YPL216WQ08964 TOM20YGR082W 552 nt7.33□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 RPL2BYIL018W 765 nt7.33□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 LSC1YOR142W 990 nt7.33□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 YBR241CYBR241C 1467 nt7.32□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 HEM2YGL040C 1029 nt7.32□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 HOC1YJR075W 1191 nt7.32□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 DID2YKR035W-A 615 nt7.32□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 YDL177CYDL177C 513 nt7.31□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 STT3YGL022W 2157 nt7.31□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 LIA1YJR070C 978 nt7.31□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 IRC11YOR013W 471 nt7.31□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.3□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.3□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.3□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.3□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 YLL066CYLL066C 3618 nt7.29□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 YMR034CYMR034C 1305 nt7.29□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 YHR020WYHR020W 2067 nt7.29□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 COQ1YBR003W 1422 nt7.29□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 GUT1YHL032C 2130 nt7.29□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 SWD1YAR003W 1281 nt7.29□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 MRPL23YOR150W 492 nt7.29□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 DFR1YOR236W 636 nt7.29□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 FCY22YER060W-A 1593 nt7.29□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 CYS4YGR155W 1524 nt7.28□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 HED1YDR014W-A 489 nt7.28□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.28□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 YKL102CYKL102C 306 nt7.28□□□□□ -1.24
YPL216WQ08964 PPH22YDL188C 1134 nt7.27□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.27□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.27□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 CCR4YAL021C 2514 nt7.27□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 CTF3YLR381W 2202 nt7.27□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 YJL045WYJL045W 1905 nt7.27□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 PEX31YGR004W 1389 nt7.26□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 LCL3YGL085W 825 nt7.26□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 FHN1YGR131W 525 nt7.26□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.26□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 YNL092WYNL092W 1203 nt7.26□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.25□□□□□ -1.25
YPL216WQ08964 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
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