Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.65■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
GOLGA3Q08378 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
GOLGA3Q08378 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GOLGA3Q08378 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
GOLGA3Q08378 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GOLGA3Q08378 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms