Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR3Q06889 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms