Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 YLR072WYLR072W 2082 nt7.21□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 PAF1YBR279W 1338 nt7.21□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 RCK1YGL158W 1539 nt7.21□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 GGC1YDL198C 903 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 TRP4YDR354W 1143 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 GRH1YDR517W 1119 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 CAK1YFL029C 1107 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 HRA1HRA1 564 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 RRT7YLL030C 342 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 AIM34YMR003W 597 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 SSP2YOR242C 1116 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 LSP1YPL004C 1026 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 ATG18YFR021W 1503 nt7.2□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 IMG2YCR071C 441 nt7.19□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 GTT3YEL017W 1014 nt7.19□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 RRT14YIL127C 621 nt7.19□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt7.19□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 YNL319WYNL319W 441 nt7.19□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 YEF1YEL041W 1488 nt7.18□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 XPT1YJR133W 630 nt7.18□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 OAC1YKL120W 975 nt7.18□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 MRPS8YMR158W 468 nt7.18□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 RUF21RUF21 707 nt7.18□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 MFA2YNL145W 117 nt7.18□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 INO1YJL153C 1602 nt7.18□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 NDE1YMR145C 1683 nt7.18□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 NDE2YDL085W 1638 nt7.17□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 YER156CYER156C 1017 nt7.17□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 NTG2YOL043C 1143 nt7.17□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 ODC2YOR222W 924 nt7.17□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 ABP1YCR088W 1779 nt7.16□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 SLM3YDL033C 1254 nt7.16□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 BIM1YER016W 1035 nt7.16□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 YLR198CYLR198C 360 nt7.16□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 OAZ1YPL052W 879 nt7.16□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 HSV2YGR223C 1347 nt7.16□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 SPS22YCL048W 1392 nt7.16□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 PTR2YKR093W 1806 nt7.15□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 DIN7YDR263C 1293 nt7.15□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 PHM8YER037W 966 nt7.15□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 AAD6YFL056C 639 nt7.15□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 RHO1YPR165W 630 nt7.15□□□□□ -1.26
HDA2Q06629 ATG32YIL146C 1590 nt7.15□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 ITR1YDR497C 1755 nt7.14□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 DIA4YHR011W 1341 nt7.14□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 DPH5YLR172C 903 nt7.14□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 NMT1YLR195C 1368 nt7.14□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 IPI3YNL182C 1668 nt7.14□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 PFA4YOL003C 1137 nt7.14□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 NFI1YOR156C 2181 nt7.13□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 TOP3YLR234W 1971 nt7.13□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 ATP10YLR393W 840 nt7.13□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YNL140CYNL140C 570 nt7.13□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YOR268CYOR268C 399 nt7.13□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 CCR4YAL021C 2514 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 THI73YLR004C 1572 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 CTF3YLR381W 2202 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 RTG3YBL103C 1461 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 TIF3YPR163C 1311 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YLL017WYLL017W 312 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YLR169WYLR169W 354 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 TSR2YLR435W 618 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YOL050CYOL050C 321 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 TAH18YPR048W 1872 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 GUT1YHL032C 2130 nt7.12□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 DHH1YDL160C 1521 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 LPL1YOR059C 1353 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 EHT1YBR177C 1356 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 UTR5YEL035C 501 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YPT31YER031C 672 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YKR104WYKR104W 921 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 RCF1YML030W 480 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 FAR3YMR052W 615 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 BXI1YNL305C 894 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 MDH2YOL126C 1134 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 DAP1YPL170W 459 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 BEM1YBR200W 1656 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 TGL5YOR081C 2250 nt7.11□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 ADA2YDR448W 1305 nt7.1□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 LRO1YNR008W 1986 nt7.1□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YDL158CYDL158C 309 nt7.1□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 GLY1YEL046C 1164 nt7.1□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YGR137WYGR137W 375 nt7.1□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YHL045WYHL045W 348 nt7.1□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 TDA4YJR116W 840 nt7.1□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 SLX1YBR228W 915 nt7.1□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 PRP46YPL151C 1356 nt7.09□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 SNF11YDR073W 510 nt7.09□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 YDR161WYDR161W 1164 nt7.09□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 MRP1YDR347W 966 nt7.09□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 PUP3YER094C 618 nt7.09□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 FSH1YHR049W 732 nt7.09□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 RPS6AYPL090C 711 nt7.09□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 RPS6BYBR181C 711 nt7.09□□□□□ -1.27
HDA2Q06629 CMR1YDL156W 1569 nt7.08□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 SHC1YER096W 1539 nt7.08□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YPR1YDR368W 939 nt7.08□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YIL086CYIL086C 309 nt7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 709.5 ms