Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GABPAQ06546 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GABPAQ06546 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms