Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAV1Q03135 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAV1Q03135 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAV1Q03135 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAV1Q03135 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAV1Q03135 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAV1Q03135 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAV1Q03135 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAV1Q03135 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAV1Q03135 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAV1Q03135 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms