Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SP3Q02447 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SP3Q02447 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SP3Q02447 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SP3Q02447 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SP3Q02447 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SP3Q02447 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SP3Q02447 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SP3Q02447 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SP3Q02447 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SP3Q02447 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SP3Q02447 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SP3Q02447 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SP3Q02447 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SP3Q02447 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SP3Q02447 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SP3Q02447 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SP3Q02447 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SP3Q02447 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SP3Q02447 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SP3Q02447 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SP3Q02447 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SP3Q02447 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SP3Q02447 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SP3Q02447 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SP3Q02447 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SP3Q02447 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SP3Q02447 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SP3Q02447 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SP3Q02447 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SP3Q02447 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP3Q02447 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP3Q02447 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP3Q02447 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP3Q02447 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SP3Q02447 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP3Q02447 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP3Q02447 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP3Q02447 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP3Q02447 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP3Q02447 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SP3Q02447 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SP3Q02447 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SP3Q02447 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SP3Q02447 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SP3Q02447 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SP3Q02447 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SP3Q02447 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SP3Q02447 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SP3Q02447 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP3Q02447 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SP3Q02447 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SP3Q02447 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SP3Q02447 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP3Q02447 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP3Q02447 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP3Q02447 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP3Q02447 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP3Q02447 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP3Q02447 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SP3Q02447 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SP3Q02447 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SP3Q02447 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SP3Q02447 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SP3Q02447 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SP3Q02447 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SP3Q02447 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SP3Q02447 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SP3Q02447 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SP3Q02447 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SP3Q02447 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SP3Q02447 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SP3Q02447 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SP3Q02447 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SP3Q02447 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SP3Q02447 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SP3Q02447 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SP3Q02447 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP3Q02447 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP3Q02447 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP3Q02447 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP3Q02447 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP3Q02447 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP3Q02447 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP3Q02447 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SP3Q02447 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SP3Q02447 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SP3Q02447 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SP3Q02447 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SP3Q02447 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SP3Q02447 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SP3Q02447 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SP3Q02447 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SP3Q02447 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SP3Q02447 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SP3Q02447 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SP3Q02447 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP3Q02447 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP3Q02447 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP3Q02447 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1117.5 ms