Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROR1Q01973 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ROR1Q01973 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROR1Q01973 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms