Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A2Q01362 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A2Q01362 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms