Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSG6Q00889 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSG6Q00889 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms