Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKB2Q00653 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKB2Q00653 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKB2Q00653 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms