Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK17Q00537 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK17Q00537 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK17Q00537 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK17Q00537 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms