Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB2P80303 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB2P80303 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NUCB2P80303 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms