Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
IRX6P78412 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IRX6P78412 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IRX6P78412 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
IRX6P78412 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
IRX6P78412 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IRX6P78412 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IRX6P78412 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
IRX6P78412 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
IRX6P78412 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IRX6P78412 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IRX6P78412 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IRX6P78412 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IRX6P78412 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IRX6P78412 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IRX6P78412 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IRX6P78412 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
IRX6P78412 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IRX6P78412 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IRX6P78412 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IRX6P78412 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IRX6P78412 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IRX6P78412 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
IRX6P78412 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IRX6P78412 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IRX6P78412 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IRX6P78412 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IRX6P78412 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IRX6P78412 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IRX6P78412 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IRX6P78412 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IRX6P78412 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
IRX6P78412 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IRX6P78412 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IRX6P78412 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IRX6P78412 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
IRX6P78412 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IRX6P78412 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32■■■□□ 2.71
IRX6P78412 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IRX6P78412 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IRX6P78412 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
IRX6P78412 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IRX6P78412 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IRX6P78412 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
IRX6P78412 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
IRX6P78412 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRX6P78412 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRX6P78412 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRX6P78412 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRX6P78412 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRX6P78412 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRX6P78412 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRX6P78412 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRX6P78412 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRX6P78412 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
IRX6P78412 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
IRX6P78412 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
IRX6P78412 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
IRX6P78412 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
IRX6P78412 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
IRX6P78412 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
IRX6P78412 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
IRX6P78412 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
IRX6P78412 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
IRX6P78412 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
IRX6P78412 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
IRX6P78412 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
IRX6P78412 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
IRX6P78412 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
IRX6P78412 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
IRX6P78412 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
IRX6P78412 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
IRX6P78412 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
IRX6P78412 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
IRX6P78412 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
IRX6P78412 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
IRX6P78412 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
IRX6P78412 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
IRX6P78412 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
IRX6P78412 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
IRX6P78412 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
IRX6P78412 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
IRX6P78412 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
IRX6P78412 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
IRX6P78412 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
IRX6P78412 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
IRX6P78412 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
IRX6P78412 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
IRX6P78412 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
IRX6P78412 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
IRX6P78412 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
IRX6P78412 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
IRX6P78412 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
IRX6P78412 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
IRX6P78412 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
IRX6P78412 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
IRX6P78412 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
IRX6P78412 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
IRX6P78412 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
IRX6P78412 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms