Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM193AP78312 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM193AP78312 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM193AP78312 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms