Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB1AP62820 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB1AP62820 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms