Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTENP60484 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTENP60484 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTENP60484 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTENP60484 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTENP60484 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTENP60484 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTENP60484 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTENP60484 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTENP60484 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTENP60484 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTENP60484 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTENP60484 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTENP60484 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTENP60484 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTENP60484 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTENP60484 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTENP60484 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTENP60484 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTENP60484 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTENP60484 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTENP60484 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTENP60484 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTENP60484 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTENP60484 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTENP60484 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTENP60484 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTENP60484 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTENP60484 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTENP60484 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTENP60484 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTENP60484 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTENP60484 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTENP60484 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTENP60484 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTENP60484 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTENP60484 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTENP60484 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTENP60484 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTENP60484 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTENP60484 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTENP60484 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTENP60484 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTENP60484 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTENP60484 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTENP60484 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTENP60484 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTENP60484 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTENP60484 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTENP60484 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTENP60484 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTENP60484 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTENP60484 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTENP60484 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTENP60484 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTENP60484 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTENP60484 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTENP60484 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTENP60484 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTENP60484 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTENP60484 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTENP60484 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTENP60484 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTENP60484 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTENP60484 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTENP60484 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTENP60484 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTENP60484 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTENP60484 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTENP60484 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTENP60484 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTENP60484 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTENP60484 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTENP60484 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTENP60484 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTENP60484 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTENP60484 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTENP60484 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTENP60484 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTENP60484 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTENP60484 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTENP60484 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTENP60484 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTENP60484 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTENP60484 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTENP60484 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTENP60484 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTENP60484 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTENP60484 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTENP60484 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTENP60484 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTENP60484 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTENP60484 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTENP60484 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTENP60484 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTENP60484 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTENP60484 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTENP60484 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTENP60484 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTENP60484 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms