Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPI1P60174 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPI1P60174 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPI1P60174 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPI1P60174 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPI1P60174 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPI1P60174 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPI1P60174 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPI1P60174 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPI1P60174 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPI1P60174 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPI1P60174 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPI1P60174 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPI1P60174 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPI1P60174 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPI1P60174 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPI1P60174 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPI1P60174 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPI1P60174 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TPI1P60174 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPI1P60174 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPI1P60174 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPI1P60174 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPI1P60174 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TPI1P60174 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPI1P60174 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPI1P60174 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPI1P60174 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPI1P60174 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPI1P60174 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPI1P60174 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPI1P60174 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPI1P60174 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPI1P60174 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPI1P60174 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPI1P60174 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPI1P60174 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPI1P60174 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TPI1P60174 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPI1P60174 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPI1P60174 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPI1P60174 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPI1P60174 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPI1P60174 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPI1P60174 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPI1P60174 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPI1P60174 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPI1P60174 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPI1P60174 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPI1P60174 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPI1P60174 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPI1P60174 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPI1P60174 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TPI1P60174 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPI1P60174 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPI1P60174 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPI1P60174 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPI1P60174 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPI1P60174 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPI1P60174 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPI1P60174 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TPI1P60174 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPI1P60174 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPI1P60174 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPI1P60174 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPI1P60174 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPI1P60174 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPI1P60174 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TPI1P60174 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPI1P60174 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPI1P60174 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPI1P60174 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPI1P60174 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPI1P60174 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPI1P60174 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPI1P60174 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPI1P60174 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPI1P60174 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPI1P60174 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPI1P60174 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPI1P60174 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPI1P60174 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPI1P60174 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPI1P60174 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPI1P60174 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPI1P60174 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPI1P60174 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPI1P60174 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPI1P60174 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPI1P60174 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPI1P60174 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TPI1P60174 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPI1P60174 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPI1P60174 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPI1P60174 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPI1P60174 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPI1P60174 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPI1P60174 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPI1P60174 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPI1P60174 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms