Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RHBDL3P58872 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RHBDL3P58872 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RHBDL3P58872 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RHBDL3P58872 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RHBDL3P58872 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RHBDL3P58872 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RHBDL3P58872 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms