Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN2P57739 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN2P57739 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms