Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RP1P56715 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RP1P56715 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RP1P56715 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RP1P56715 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RP1P56715 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP1P56715 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP1P56715 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RP1P56715 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP1P56715 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP1P56715 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP1P56715 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RP1P56715 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RP1P56715 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RP1P56715 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RP1P56715 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RP1P56715 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RP1P56715 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RP1P56715 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP1P56715 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP1P56715 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP1P56715 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP1P56715 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP1P56715 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP1P56715 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP1P56715 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RP1P56715 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP1P56715 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP1P56715 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP1P56715 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP1P56715 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP1P56715 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP1P56715 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP1P56715 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RP1P56715 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RP1P56715 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RP1P56715 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RP1P56715 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RP1P56715 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RP1P56715 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP1P56715 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP1P56715 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP1P56715 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP1P56715 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP1P56715 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP1P56715 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RP1P56715 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RP1P56715 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RP1P56715 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP1P56715 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP1P56715 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP1P56715 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP1P56715 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP1P56715 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP1P56715 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP1P56715 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RP1P56715 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RP1P56715 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RP1P56715 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RP1P56715 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RP1P56715 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RP1P56715 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP1P56715 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP1P56715 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP1P56715 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP1P56715 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP1P56715 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP1P56715 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP1P56715 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RP1P56715 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP1P56715 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP1P56715 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP1P56715 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP1P56715 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP1P56715 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP1P56715 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RP1P56715 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP1P56715 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP1P56715 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RP1P56715 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RP1P56715 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RP1P56715 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RP1P56715 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP1P56715 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP1P56715 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP1P56715 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP1P56715 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RP1P56715 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RP1P56715 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RP1P56715 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RP1P56715 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RP1P56715 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RP1P56715 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RP1P56715 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RP1P56715 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP1P56715 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP1P56715 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP1P56715 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP1P56715 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP1P56715 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms