Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1S2P56377 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP1S2P56377 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms