Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC13P55735 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC13P55735 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC13P55735 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC13P55735 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC13P55735 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC13P55735 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC13P55735 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC13P55735 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC13P55735 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC13P55735 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC13P55735 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC13P55735 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC13P55735 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC13P55735 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC13P55735 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC13P55735 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC13P55735 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC13P55735 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC13P55735 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC13P55735 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC13P55735 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC13P55735 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC13P55735 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC13P55735 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC13P55735 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC13P55735 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC13P55735 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC13P55735 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC13P55735 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC13P55735 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC13P55735 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC13P55735 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC13P55735 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC13P55735 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC13P55735 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC13P55735 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC13P55735 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC13P55735 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC13P55735 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC13P55735 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC13P55735 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC13P55735 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC13P55735 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC13P55735 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC13P55735 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC13P55735 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC13P55735 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC13P55735 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC13P55735 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC13P55735 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC13P55735 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC13P55735 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC13P55735 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC13P55735 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC13P55735 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC13P55735 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC13P55735 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC13P55735 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC13P55735 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC13P55735 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC13P55735 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC13P55735 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC13P55735 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC13P55735 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC13P55735 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC13P55735 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC13P55735 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC13P55735 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC13P55735 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC13P55735 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC13P55735 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC13P55735 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC13P55735 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC13P55735 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC13P55735 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC13P55735 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC13P55735 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC13P55735 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC13P55735 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC13P55735 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC13P55735 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC13P55735 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC13P55735 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC13P55735 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC13P55735 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC13P55735 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC13P55735 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC13P55735 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC13P55735 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms