Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPD52P55327 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPD52P55327 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPD52P55327 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPD52P55327 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPD52P55327 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52P55327 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52P55327 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52P55327 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52P55327 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52P55327 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52P55327 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52P55327 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52P55327 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52P55327 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52P55327 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52P55327 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52P55327 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52P55327 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52P55327 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52P55327 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52P55327 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52P55327 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52P55327 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52P55327 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52P55327 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52P55327 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52P55327 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52P55327 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52P55327 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52P55327 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52P55327 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52P55327 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52P55327 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52P55327 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52P55327 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPD52P55327 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPD52P55327 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPD52P55327 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPD52P55327 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52P55327 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52P55327 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52P55327 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52P55327 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPD52P55327 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPD52P55327 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPD52P55327 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52P55327 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52P55327 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52P55327 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52P55327 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52P55327 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52P55327 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52P55327 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52P55327 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52P55327 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52P55327 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52P55327 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52P55327 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52P55327 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52P55327 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52P55327 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52P55327 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52P55327 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52P55327 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52P55327 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52P55327 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52P55327 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52P55327 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52P55327 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52P55327 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52P55327 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52P55327 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPD52P55327 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPD52P55327 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPD52P55327 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPD52P55327 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPD52P55327 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52P55327 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52P55327 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52P55327 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52P55327 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52P55327 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52P55327 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52P55327 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms