Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH15P55291 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH15P55291 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH15P55291 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH15P55291 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH15P55291 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH15P55291 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH15P55291 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH15P55291 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH15P55291 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH15P55291 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH15P55291 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH15P55291 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH15P55291 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH15P55291 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH15P55291 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH15P55291 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH15P55291 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH15P55291 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH15P55291 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH15P55291 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH15P55291 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH15P55291 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH15P55291 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH15P55291 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH15P55291 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH15P55291 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH15P55291 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH15P55291 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH15P55291 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH15P55291 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH15P55291 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH15P55291 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH15P55291 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH15P55291 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH15P55291 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH15P55291 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH15P55291 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH15P55291 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH15P55291 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH15P55291 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH15P55291 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH15P55291 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH15P55291 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH15P55291 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH15P55291 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH15P55291 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH15P55291 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH15P55291 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH15P55291 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH15P55291 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH15P55291 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH15P55291 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH15P55291 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH15P55291 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH15P55291 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH15P55291 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH15P55291 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH15P55291 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH15P55291 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH15P55291 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH15P55291 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH15P55291 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH15P55291 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH15P55291 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH15P55291 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH15P55291 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH15P55291 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH15P55291 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH15P55291 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH15P55291 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH15P55291 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH15P55291 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH15P55291 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH15P55291 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH15P55291 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH15P55291 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH15P55291 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH15P55291 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH15P55291 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH15P55291 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH15P55291 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH15P55291 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH15P55291 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH15P55291 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH15P55291 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH15P55291 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH15P55291 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH15P55291 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH15P55291 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH15P55291 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH15P55291 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH15P55291 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH15P55291 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH15P55291 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH15P55291 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH15P55291 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH15P55291 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH15P55291 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH15P55291 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms