Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEMP55040 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEMP55040 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GEMP55040 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMP55040 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMP55040 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMP55040 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMP55040 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMP55040 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMP55040 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEMP55040 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMP55040 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMP55040 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMP55040 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMP55040 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMP55040 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMP55040 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEMP55040 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEMP55040 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEMP55040 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEMP55040 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEMP55040 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GEMP55040 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GEMP55040 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GEMP55040 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GEMP55040 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GEMP55040 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GEMP55040 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GEMP55040 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEMP55040 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEMP55040 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEMP55040 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEMP55040 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEMP55040 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEMP55040 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEMP55040 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEMP55040 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEMP55040 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEMP55040 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEMP55040 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GEMP55040 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GEMP55040 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GEMP55040 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GEMP55040 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GEMP55040 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GEMP55040 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GEMP55040 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GEMP55040 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GEMP55040 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GEMP55040 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEMP55040 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEMP55040 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEMP55040 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GEMP55040 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEMP55040 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEMP55040 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEMP55040 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GEMP55040 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GEMP55040 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GEMP55040 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GEMP55040 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GEMP55040 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GEMP55040 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GEMP55040 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEMP55040 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GEMP55040 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GEMP55040 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GEMP55040 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GEMP55040 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GEMP55040 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GEMP55040 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GEMP55040 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEMP55040 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEMP55040 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEMP55040 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEMP55040 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEMP55040 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEMP55040 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEMP55040 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEMP55040 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GEMP55040 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms