Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA8P53708 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA8P53708 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA8P53708 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms