Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVDP53602 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVDP53602 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVDP53602 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVDP53602 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVDP53602 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVDP53602 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVDP53602 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVDP53602 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVDP53602 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVDP53602 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVDP53602 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVDP53602 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVDP53602 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVDP53602 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVDP53602 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVDP53602 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVDP53602 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVDP53602 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVDP53602 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVDP53602 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVDP53602 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVDP53602 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVDP53602 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVDP53602 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVDP53602 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVDP53602 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVDP53602 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVDP53602 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVDP53602 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVDP53602 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVDP53602 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVDP53602 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVDP53602 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVDP53602 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVDP53602 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVDP53602 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVDP53602 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVDP53602 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVDP53602 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVDP53602 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVDP53602 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVDP53602 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVDP53602 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVDP53602 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVDP53602 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVDP53602 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVDP53602 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVDP53602 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVDP53602 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVDP53602 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVDP53602 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVDP53602 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MVDP53602 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MVDP53602 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MVDP53602 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MVDP53602 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MVDP53602 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MVDP53602 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MVDP53602 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MVDP53602 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MVDP53602 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVDP53602 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVDP53602 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MVDP53602 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MVDP53602 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms