Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HK3P52790 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HK3P52790 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HK3P52790 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HK3P52790 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HK3P52790 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HK3P52790 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HK3P52790 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HK3P52790 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HK3P52790 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HK3P52790 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HK3P52790 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HK3P52790 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HK3P52790 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HK3P52790 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HK3P52790 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HK3P52790 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HK3P52790 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HK3P52790 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HK3P52790 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HK3P52790 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HK3P52790 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HK3P52790 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HK3P52790 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HK3P52790 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HK3P52790 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HK3P52790 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HK3P52790 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HK3P52790 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HK3P52790 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HK3P52790 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HK3P52790 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HK3P52790 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HK3P52790 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HK3P52790 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HK3P52790 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HK3P52790 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HK3P52790 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HK3P52790 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HK3P52790 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HK3P52790 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HK3P52790 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HK3P52790 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HK3P52790 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HK3P52790 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HK3P52790 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HK3P52790 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HK3P52790 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HK3P52790 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HK3P52790 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HK3P52790 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HK3P52790 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HK3P52790 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HK3P52790 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HK3P52790 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HK3P52790 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HK3P52790 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HK3P52790 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HK3P52790 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HK3P52790 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HK3P52790 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HK3P52790 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HK3P52790 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HK3P52790 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HK3P52790 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HK3P52790 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HK3P52790 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HK3P52790 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HK3P52790 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HK3P52790 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HK3P52790 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HK3P52790 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HK3P52790 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HK3P52790 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HK3P52790 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HK3P52790 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HK3P52790 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HK3P52790 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HK3P52790 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HK3P52790 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HK3P52790 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HK3P52790 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms